蓝莲盛开，身心自在~
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生物信息学 143 技能 4 R语言 29 软件使用 6 Julia 1 Linux 1 文献阅读 22 统计学 5 文献 11 Python 7 Tools4You 6 swxxx 1 分子生物学 3 数据库 2 杂文 2 hexo 1 生物学信息学 1 科研 1 生物信息学 - 群体遗传学 - Linux 1
GENIE3构建基因调控网络 GENIE3构建基因调控网络
最近一直寻思着构建基因共表达网络，之前了解到的方法是根据相关性构建互作网络。想着看看有没有新的方法，找到了这样一篇文献： 谷歌学术显示该文章已经被引用940余次，引用的期刊不乏Nature等。 具体的算法实现过程看不懂，那就应用吧。
2021-07-06 R语言
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clusterProfiler做富集分析 clusterProfiler做富集分析
最近在分析水稻的转录组数据，用的参考基因组是我们小组自己组装的，没有用常见的那几个参考基因组做比对，这就导致一个问题，得到的基因ID是我们参考基因组上的，而不是常见的水稻基因ID，也就无法转换成ENTREZID，想要用clusterProf
2021-03-31 R语言
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MiKTeX安装报错解决办法 MiKTeX安装报错解决办法
最近打算用bookdown记实验记录，实在是受不了Word了。使用bookdown需要使用MiKTeX，安装的时候我选择的是一路默认，使用的时候还是会报错，尝试了几次，找到了解决办法： 💌lixiang117423@foxmail.
2021-03-05 R语言
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ggplot2柱状图相关 ggplot2柱状图相关
之前在公众号上的文章，查看不方便，搬到个人博客好了。 rm(list = ls()) library(tidyverse) library(ggplot2) library(ggsci) library(reshape2) data
2021-03-01 R语言
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ggtree学习笔记 ggtree学习笔记
写在前面Y叔的ggtree $^{[1]}$ 毫无疑问是当前绘制美化系统发育树（下文简称进化树）的最佳工具，一直想学习，但是都没有真真正正学习过，一是因为网上关于gtree的中文资源较少，另外一个原因是感觉到自己用不上，就没认真学习。春节在
2021-02-15 R语言
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ggprism学习笔记 ggprism学习笔记
这个包简直就是完美啊！！！ # for the graph library(ggplot2) library(ggprism) library(ggnewscale) # just for manipulating the data.fr
2021-02-08 R语言
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