MCScanX遇到的一个坑

软件使用
生物信息学
Publish Date:   2023-04-16
Update Date:   2023-12-10
Word Count:   74
Read Times:   1 Min
Read Count:  

输入一个巨大的基因组都没有得到结果，最后发现gff文件需要整理成这样的才行：

1_352   Zm00001eb015320_T001    52489256        52490901
1_352   Zm00001eb015320_T002    52489256        52490901
1_352   Zm00001eb015320_T003    52489489        52490901
1_352   Zm00001eb020400_T001    75800802        75801504
1_352   Zm00001eb025220_T001    107564069       107566034
1_352   Zm00001eb030990_T001    171853294       171855490
1_352   Zm00001eb030990_T002    171853349       171855490
1_352   Zm00001eb042020_T001    221467932       221469468
1_352   Zm00001eb051120_T002    259960362       259963720
1_352   Zm00001eb051120_T001    259960362       259963720
Author: 李详【Xiang LI】
Link: http://www.web4xiang.top/blog/blog/article/mcscanx/
Reprint policy: All articles in this blog are used except for special statements CC BY 4.0 reprint policy. If reproduced, please indicate source 李详【Xiang LI】 !
软件使用
赏
  TOC